Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Igkv4-55-201ENSMUST00000103359 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Obp2b-201ENSMUST00000114192 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm12425-201ENSMUST00000119580 363 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 D730003I15Rik-201ENSMUST00000139056 716 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm7076-201ENSMUST00000152421 456 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ube4bos2-201ENSMUST00000154000 317 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm22881-201ENSMUST00000157747 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 n-R5s210-201ENSMUST00000177688 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm42654-201ENSMUST00000200789 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm42557-201ENSMUST00000202037 582 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm45510-201ENSMUST00000210059 638 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 5830408C22Rik-204ENSMUST00000211653 351 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm33700-201ENSMUST00000215123 697 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm24826-201ENSMUST00000083695 215 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Zdhhc22-201ENSMUST00000095521 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ccser2-209ENSMUST00000183038 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm18639-201ENSMUST00000210442 1769 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mitf-203ENSMUST00000101123 2144 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mitf-204ENSMUST00000113339 2144 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm28453-202ENSMUST00000185975 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm16559-201ENSMUST00000160080 1564 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms