Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Cdh26-201ENSMUST00000042092 2891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Lage3-203ENSMUST00000114153 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Rmi1-205ENSMUST00000225828 3594 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm20485-201ENSMUST00000174452 394 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gpr55-201ENSMUST00000086975 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Zscan21-205ENSMUST00000110961 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gja1-206ENSMUST00000220069 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms