Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm12864-201ENSMUST00000122207 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ubap2l-220ENSMUST00000199834 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Rnf6-208ENSMUST00000169407 3276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 2610001J05Rik-204ENSMUST00000185361 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Zmynd8-201ENSMUST00000018050 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Cyb5d2-203ENSMUST00000156294 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ttc17-204ENSMUST00000111238 4590 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Pnma2-202ENSMUST00000122431 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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