Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Acad12-201ENSMUST00000041252 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm15533-202ENSMUST00000206216 3262 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Rnf6-208ENSMUST00000169407 3276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Nudt13-201ENSMUST00000022343 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Unc45b-201ENSMUST00000018989 3549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cpa5-203ENSMUST00000115139 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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