Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VhlP40338 Klrb1c-203ENSMUST00000174404 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VhlP40338 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VhlP40338 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VhlP40338 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VhlP40338 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VhlP40338 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VhlP40338 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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VhlP40338 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 CT030646.1-201ENSMUST00000225049 980 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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VhlP40338 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm37168-201ENSMUST00000192965 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm4858-203ENSMUST00000195847 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VhlP40338 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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VhlP40338 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm15841-201ENSMUST00000160540 517 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VhlP40338 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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