Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3238W4VSP7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3238W4VSP7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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