Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc166S4R181 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms