Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms