Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd3Q9Z2D8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms