Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn8Q9Z260 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms