Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ap3b1Q9Z1T1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms