Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Setbp1Q9Z180 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setbp1Q9Z180 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Setbp1Q9Z180 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms