Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp2Q9Z0Z3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms