Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NgfrQ9Z0W1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms