Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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ArcQ9WV31 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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ArcQ9WV31 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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ArcQ9WV31 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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ArcQ9WV31 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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ArcQ9WV31 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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ArcQ9WV31 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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ArcQ9WV31 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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ArcQ9WV31 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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ArcQ9WV31 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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ArcQ9WV31 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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ArcQ9WV31 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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ArcQ9WV31 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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ArcQ9WV31 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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ArcQ9WV31 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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ArcQ9WV31 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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ArcQ9WV31 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ArcQ9WV31 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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