Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrQ9WUZ7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bgrQ9WUZ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms