Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx9Q9WUH2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms