Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms