Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc2Q9R244 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms