Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TapbpQ9R233 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms