Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubd1Q9R1K7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubd1Q9R1K7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms