Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit2Q9R1B9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slit2Q9R1B9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms