Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed2Q9R0Q3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed2Q9R0Q3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed2Q9R0Q3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed2Q9R0Q3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed2Q9R0Q3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed2Q9R0Q3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed2Q9R0Q3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms