Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh2d3cQ9QZS8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms