Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a3Q9QZS0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col4a3Q9QZS0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms