Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas3Q9QZQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms