Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc4Q9QZD4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Ercc4Q9QZD4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ercc4Q9QZD4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Ercc4Q9QZD4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ercc4Q9QZD4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Ercc4Q9QZD4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc4Q9QZD4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Ercc4Q9QZD4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ercc4Q9QZD4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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