Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms