Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg3Q9QYF9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndrg3Q9QYF9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms