Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh11Q9QYF1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rdh11Q9QYF1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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