Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VapbQ9QY76 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VapbQ9QY76 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms