Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp1Q9QY53 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp1Q9QY53 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms