Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn4Q9QXZ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn4Q9QXZ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn4Q9QXZ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn4Q9QXZ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms