Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2e3Q9QXZ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2e3Q9QXZ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms