Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad18Q9QXK2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad18Q9QXK2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms