Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Limd1Q9QXD8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Limd1Q9QXD8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms