Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phc2Q9QWH1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phc2Q9QWH1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms