Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdcQ9QW08 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms