Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcea2Q9QVN7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcea2Q9QVN7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms