Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csnk1eQ9JMK2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms