Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfmbt1Q9JMD1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfmbt1Q9JMD1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms