Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp2Q9JLK4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp2Q9JLK4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp2Q9JLK4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp2Q9JLK4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp2Q9JLK4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp2Q9JLK4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cabp2Q9JLK4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cabp2Q9JLK4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms