Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod4Q9JLH8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod4Q9JLH8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms