Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prg3Q9JL95 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms