Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gde1Q9JL56 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms