Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot9Q9JKY0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms