Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmx1aQ9JKU8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms