Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms