Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Msgn1Q9JK54 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms