Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl3Q9JJR7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms